生態問題
為了防止小說低俗，正規的網絡文學網站都有自己的敏感詞庫。可是，在正常的小說描寫中，有時候作者避免不了描寫一些愛情的場景，一篇小說中可能只有幾百字。文學網站之間存在激烈的競爭，有時就會利用這一漏洞，相互舉報對方涉及低俗。文學作品反而會劣幣驅逐良幣，有的小說開始游走在曖昧邊緣，少數低俗的作品開始出現，影響整個網絡生態。
抄襲問題
某一本網絡小說火了之后，有一些作者就會跟風，寫一部故事脈絡差不多的小說。在這個過程中，很難界定是否存在抄襲，反而影響了原創作者的積極性。有一些網絡作者，對是否抄襲的概念認知比較模糊，甚至存在有人覺得某些小說情節比較好，就“借鑒”過來，實際上與抄襲并無區別。
工作室轉包問題
在網絡小說市場，銷售作品的時候，常見的是以工作室的方式進行。在小說創作初期，網站見到不錯的作品，就會事先簽約，作者邊創作，網站邊按時支付稿費，比如約定千字100元，有的工作室簽約后，就以50元的價格轉包出去，導致作品的質量大不如前，最終影響購買平臺的利益。
行業盈利問題
網絡文學作者和編輯的跳槽是常事，有的網絡文學平臺，好不容易培養了一個成熟作者，就被其他平臺挖過去，造成不良競爭。有業內人士做了測算，網站支付作者千字100元的稿酬，至少需要3000人訂閱小說。如果網站平臺要覆蓋成本，則需要5000人訂閱，平臺的運營成本很大。如今，IP銷售很火，成為新的盈利點。如果保證平臺獲益，就需與作者簽訂“霸王條款”進行約束，導致雙方分歧加大，增加跳槽幾率，形成了惡性循環。
